Vanaf 1766 diende het verbouwde koor van de in 1765 door de gemeente Utrecht aangekochte Mariakerk aan de Mariaplaats als stadsmuziekzaal. In 1839 nam het Collegium Musicum Ultrajectinum als belangrijkste gebruiker het initiatief tot een verbouwing, waarvoor de plannen werden opgesteld door een commissie waarin de gemeente als eigenaar een belangrijke rol speelde. Het uiteindelijke ontwerp behelsde in feite nieuwbouw op de plaats van het oude koor. In 1847 werd het nieuwe Gebouw voor Kunsten en Wetenschappen ingewijd. De drie belangrijkste huurders van dit gebouw waren: de Stadstekenscholen (tot 1866), het Genootschap Kunstliefde en het Collegium Musicum Ultrajectinum. Vanaf 1 september 1920 werd het toezicht op het beheer uitgeoefend door de Schouwburgcommissie, waarna de Stadsschouwburg in 1947 de exploitatie overnam. Tot in de jaren zeventig van de twintigste eeuw vervulde het Gebouw voor Kunsten en Wetenschappen een nuttige functie voor het culturele leven in Utrecht. Het exploitatieverlies was voor de gemeente Utrecht een reden om het gebouw in 1974 te verkopen aan het Utrechts Conservatorium.