De bij de archieven van het stadsbestuur van Utrecht bewaarde archieven zijn in 1913 en 1917 respectievelijk gepubliceerd in:
- Catalogussen van de bij het Stads-archief bewaarde archieven: eerste afdeeling, de aan de stad Utrecht behoorende archieven, door S. Muller Fz
- Catalogussen van de bij het Stads-archief bewaarde archieven: tweede afdeeling, de aan de stad Utrecht in bewaring gegeven archieven, door W.C. Schuylenburg en J.G.C. Joosting

In 1996 is besloten tot het overtypen van deze inventarissen, omdat de gedrukte exemplaren toe waren aan een ‘face-lift’.

Voor elk van de oorspronkelijke inventarissen is destijds één doorschoten exemplaar vervaardigd, waarin vervolgens in de loop der jaren alle veranderingen en aanvullingen geschreven werden. Dit doorschoten exemplaar, dat in de studiezaal gebruikt werd, was uiteraard aan slijtage onderhevig. Om dit enige exemplaar met volledige bijschrijvingen te redden, is uiteindelijk besloten de gehele bijgewerkte inventaris in de computer in te voeren.

Om duidelijk te laten blijken dat het slechts gaat om overgetypte inventarissen en niet om herziene versies, is de oorspronkelijke tekst zoveel mogelijk intact gelaten. De oude spelling en interpunctie zijn gehandhaafd en de vormgeving is in grote lijnen overgenomen.

Utrecht, 1996
J.N. van der Meulen

In 2001 is een project gestart om beschrijvingen waarbij onder één inventarisnummer meerdere materiële eenheden beschreven waren, te splitsen (specificeren) in meerdere subnummers -1, -2, enz. Ook de inventarissen van de archieven van de stad Utrecht 1122-1813, en die van de bij het stadsarchief Bewaarde archieven vormden onderdeel van dit project. Het ging hierbij met name om specificatie van de materiële eenheden delen, banden en charters. In 2006 zijn de in het specificatieproject verzamelde gegevens verwerkt in de overgetypte inventaris uit 1996.

Utrecht, 2006
K. van Vliet

De oorspronkelijke toegang op de bij de archieven van het stadsbestuur van Utrecht bewaarde archieven, in bewaring gegeven aan de stad (tweede afdeling) stond in de volksmond bekend als 'Bewaarde Archieven II'. De in deze toegang opgenomen archieven waren in vier hoofdrubrieken ingedeeld:

A. Archief van kerkvoogden der Nederduitsche Hervormde Gemeente
B. Archief van regenten van het Gereformeerd Burgerweeshuis
C. Archief van regenten der Vereenigde Gods- en Gasthuizen
D. Archief van regenten van het Krankzinnigengesticht

Omstreeks 1990 is als gevolg van de invoer van een geautomatiseerd archiefbeheersysteem bij de Gemeentelijke Archiefdienst Utrecht de toegang op de bij de archieven van het stadsbestuur van Utrecht bewaarde archieven, in bewaring gegeven aan de stad (oorspronkelijke tweede afdeling), opgesplitst in vierentwintig toegangen:

Rubriek A: Archief van kerkvoogden der Nederduitsche Hervormde Gemeente:
- toegangnr. 709-1: archief van kerkmeesters van de Buurkerk (inv.nrs. 1-370)
- toegangnr. 709-2: archief van kerkmeesters van de S. Jacobskerk (inv.nrs. 371-682)
- toegangnr. 709-3: archief van kerkmeesters van de S. Nicolaaskerk (inv.nrs. 683-763)
- toegangnr. 709-4: archief van kerkmeesters van de S. Geertruidakerk (inv.nrs. 764-847)
- toegangnr. 709-5: archief van de Engelse kerk (inv.nrs. 848-849)
Rubriek B: Archief van regenten van het Gereformeerd Burgerweeshuis:
- toegangnr. 709-6: archief van het Regulierenklooster (inv.nrs. 850-999)
- toegangnr. 709-7: archief van het Elisabeths-gasthuis (inv.nrs. 1000-1069)
- toegangnr. 709-8: archief van de Bank van Lening (inv.nrs. 1070-1243)

Rubriek C: Archief van regenten der Vereenigde Gods- en Gasthuizen:
- toegangnr. 709-9: archief van het S. Catharijne-gasthuis (inv.nrs. 1244-1248)
- toegangnr. 709-10: archief van het S. Barbara- en St. Laurens-gasthuis (inv.nrs. 1249-1600)
- toegangnr. 709-11: archief van het S. Bartholomeus-gasthuis (inv.nrs. 1601-1832)
- toegangnr. 709-12: archief van het Heilige Kruis-gasthuis (inv.nrs. 1833-1981)
- toegangnr. 709-13: archief van het S. Anthonie-gasthuis (inv.nrs. 1982-2049)
- toegangnr. 709-14: archief van het S. Maartens-gasthuis (inv.nrs. 2050-2080)
- toegangnr. 709-15: archief van het S. Jobs-gasthuis (inv.nrs. 2081-2199)
- toegangnr. 709-16: archief van het gasthuis Leeuwenberch (inv.nrs. 2200-2252)
- toegangnr. 709-17: archief van het S. Apostelgasthuis (inv.nrs. 2253-2261)
- toegangnr. 709-18: archief van de Armen-noodhulp (inv.nrs. 2262-2390)
- toegangnr. 709-19: archief van de Zuylens-kameren (inv.nrs. 2391-2440)
- toegangnr. 709-20: stukken waarvan niet duidelijk is tot welk gasthuis archief ze behoren (inv.nrs. 2441-2497)
- toegangnr. 709-21: archief van het S. Jacobs-gasthuis (inv.nrs. 2498-2504)
- toegangnr. 709-22: archief van het S. Joosten-gasthuis (inv.nrs. 2505-2510)
- toegangnr. 709-23: archief van het S. Martha-gasthuis (inv.nrs. 2511-2513)
Rubriek D: Archief van regenten van het Krankzinnigengesticht:
- toegangnr. 709-24: archief van het Dolhuis (Krankzinnigengesticht) (inv.nrs. 2514-2651)

In 2013 is besloten om de vierentwintig toegangen weer samen te voegen tot één inventaris met toegangsnr. 709.

Utrecht, 2013
T.L.H. van de Sande