- Archief van de Commissie inzake den kostenden prijs voor de Krankzinnigenverpleging, 1919-1921 (0,03 m)
- Archief van de Commissie van advies inzake de grenswijziging Utrecht-Oost, 1922-1933 (0,16 m)
- Archief van het Georganiseerd Overleg van de Provincie Utrecht, 1929-1954 (0,19 m)
- Archief van de Rijkscommissie van advies voor de werkverruiming in de Provincie Utrecht, 1936-1952 (0,90 m)
- Archief van de Commissie van advies inzake de regeling van de bebouwing in de Provincie Utrecht (Provinciale Bebouwingscommissie), 1936-1943 (0,90 m)
- Archief van de Streekplan(studie)commissie voor Utrecht en omstreken, 1939-1948 (0,15)
- Archief van Stichting De Grebbecommissie, 1940-1948 (1959) (1,5 m)
- Archief van Stichting Herstel Provincie Utrecht 1940, 1940-1951 (3,13 m)
- Archief van den Algemeen Gemachtigde voor den wederopbouw en voor de bouwnijverheid, 1940-1943 (1945) (2,37 m)
- Archief van de Stichting Centraal Bureau voor wederopbouw in de Provincie Utrecht, 1940-1943 (1950) (1,75 m)
- Archief van het Secretariaat van den Commissaris der Provincie, 1941-1945 (2,06 m)
- Archief van de Commissie van advies voor de oorlogs- of vredesgedenkteekens in de Provincie Utrecht, (1945) 1946-1961 (0,38 m)
- Archief van de Provinciale demobilisatiecommissie, 1947-1949 (1951) (0,03 m)
- Archief van de Commissie ter bestudering van het vraagstuk van het buitengewoon lager onderwijs in de provincie Utrecht, 1948-1954 (0,19 m)
- Archief van de Commissie van onderzoek inzake de vervening en drooglegging van de Vinkeveense plassen, 1949-1954 (0,06 m)
Het doel van dit secretariaat (níet als zodanig geformuleerd) was de behartiging van de partijzaken van de Nationaal-Socialistische Beweging ten behoeve van de Commissaris, die lid van deze partij was. De secretaris werd rechtstreeks onder de Commissaris gesteld.
Per 1 september 1941 gingen de taken van Gedeputeerde Staten over op de Commissaris der Provincie (Verordening van den Rijkscommissaris voor het bezette Nederlandsche gebied 152/41). Als vervolg op deze maatregelen heeft de Commissaris bij besluiten d.d. 1 september 1941, Secretariaat nrs. 514 en 515, bepaald dat met ingang van 1 september:
- de gehele postontvangst van het provinciaal bestuur plaats vond bij het Secretariaat (vgl. besluit van de Commissaris d.d. 18 augustus 1941, Secretariaat nr. 419);
- de 5de afdeling der provinciale griffie werd opgeheven en het werk van deze afdeling werd overgenomen door het Secretariaat (behandeling van alle zaken verband houdende met de bezetting, uitgezonderd de R-verrichtingen, vergoeding van vorderingen door de Wehrmacht, die naar de 1ste afdeling gingen);
- de 4de afdeling der provinciale griffie (Kabinet van de Commissaris der Provincie) onder het Secretariaat werd gesteld.
Na het vertrek van de eerste secretaris (besluit van de Commissaris d.d. 29 november 1941, Secretariaat nr. 800) kwamen er opvolgers die een administratieve chaos achterlieten. Stukken die bij het Kabinet waren ingeboekt zijn alsnog overgenomen door het Secretariaat. Een agenda werd niet overgeleverd. Om deze redenen zijn de stukken van 1 januari 1942 af chronologisch op afdoening hergeordend. De verslagen zijn aangetroffen als afzonderlijke collecties.
De archiefvorming kwam tot een eind op 6 mei 1945, een dag voor de feitelijke bevrijding en het daarmee wegvallen van elke activiteit van de Nationaal-Socialistische Beweging.